納稅義務人在稅捐查核與爭訟實務上所負之協力義務，尤其是說明提示義務，對於其實體法上的權利義務影響甚鉅。在納保法施行後，期待稅捐主管機關與行政法院能從「務實」的角度看待協力義務，使協力義務在事前可以被預見、合理而可達成，並將納稅義務人之成本效益納入考慮，以充分保障賦稅人權。
協力義務包括：稅籍登記、保持帳簿、憑證、稅捐申報、說明提示與到場備詢，其中說明提示義務最易引起徵納雙方爭議。
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