臺灣大宗養殖物種養殖環境微生物對碳排放的影響

本研究以台灣大宗養殖物種—文蛤為對象，探討養殖環境中微生物群落結構及功能對碳排放之影響。研究結合Oxford Nanopore定序技術、FAPROTAX功能預測及實測CO2排放數據，分析底泥與水體在健康、死亡中及死亡三種狀態下的生態變遷。結果顯示，文蛤養殖環境之CO2排放與微生物代謝活性具高度相關。健康環境展現較高的基礎代謝率（底泥平均48.84 mg／L），與其具備穩定的木質素與幾丁質降解功能相符；而當環境惡化至死亡階段，微生物群落發生劇烈演替，化能異營與發酵功能因屍體腐敗而顯著上調，導致CO2釋放量在經歷病程初期的下降後再次回升。網絡分析進一步證實，CO2排放與Aliidongia、Thiolapillus等核心菌屬及其發酵路徑具顯著正相關。本研究建構之環境模式圖清晰呈現了養殖系統從健康狀態下的「平衡碳循環」，演變至死亡狀態下「高負荷腐敗代謝」的過程。研究成果不僅界定了反映養殖環境健康度的微生物功能指標，亦為水產養殖業之低碳轉型與精準環境監控提供了重要的科學基礎。