營業稅溢繳退還在申報與申請程序上的差異與實務疑義【法規解讀】

Differences and Practical Questions Regarding the Declaration and Application Procedures for Refunds of Overpaid Business Tax

加值型及非加值型營業稅法（下稱營業稅法）第39條規定：「Ⅰ.營業人申報之左列溢付稅額，應由主管稽徵機關查明後退還之：一、因銷售第7條規定適用零稅率貨物或勞務而溢付之營業稅。二、因取得固定資產而溢付之營業稅。三、因合併、轉讓、解散或廢止申請註銷登記者，其溢付之營業稅。Ⅱ.前項以外之溢付稅額，應由營業人留抵應納營業稅。但情形特殊者，得報經財政部核准退還之。」第1項規定，從文義可知係由稅局就營業人之申報內容，查明後退還。第2項但書則僅規定由稅局報經財政部核准後退還，並未規定是否由營業人申請或申報；但實務上是由營業人申請，再由稅局報經財政部核准後退還。換言之，都是溢付稅額的退還，第1項規定是以「申報書」的形式向稅局主張之；第2項但書規定則是以「申請書」的形式為之。本文將介紹實務上經財政部依據第2項但書規定核准之解釋函令。