次世代定序於感染管制之應用

在過去二十年中，由於分子診斷迅速發展，並在醫學微生物實驗室中發揮了越來越重要的作用，縮短了從接收樣本到最終結果的週期時間，並使檢測不可培養的病原體成為可能。這些技術中最重要為序列分析，尤其是病原體基因或全基因組進行序列分析。起源於第一代定序Sanger sequencing，次世代定序（Next-generation sequencing, NGS或稱高通量定序）為一結合生物資訊（bioinformatics）之一種強大的工具可用於檢測、識別和分析人類病原體。與傳統方法相比，因為所產生的序列可以用於更精確地檢測和描繪病原體特徵，篩檢抗藥性突變／基因、檢驗疫苗逃逸變異、重組或重配（combination or reassortment）以及致病性和毒力因子。