應用WGS-PCR方法輔助痢疾桿菌鑑定之探討

志賀氏桿菌會引起桿菌性痢疾，目前列為我國之第二類法定傳染病，此病原近五年每年平均造成104例的本土個案。由於志賀氏桿菌鑑定標準方法係以傳統生化試驗配合血清學分型，但此法仍無法明確鑑定部份的志賀氏桿菌，造成臨床醫學實驗室通報的困擾。為提升志賀桿菌的鑑別度，本研究以臨床分離株測試以基因體為基礎的PCR分型法(WGS-PCR)，此法主要測定志賀氏桿菌基因體的各個演化枝，並搭配志賀氏菌及腸侵襲性大腸桿菌(enteroinvasive E. coli, EIEC)專一性基因IpaH的測定，來鑑定出志賀氏菌的血清群。我們以30株痢疾桿菌確認菌株進行驗證，發現WGS-PCR在血清群B、C、D的結果與血清凝集法有100%的一致性，但在血清群A的結果與血清凝集法僅有20%一致。另外以WGS-PCR測試29株疑似痢疾桿菌菌株，各有2株菌株被鑑定為血清群B及D，亦顯示WGS-PCR可用於鑑定血清群B及D菌株，可明確釐清疑似菌株。WGS-PCR只需進行低成本的PCR檢驗，我們建議可作為血清凝集法的輔助試驗，以提升志賀氏菌的鑑別度。