當家事調解遇上家庭暴力

阿雄與其妻阿芳育有二個未成年子女。阿雄經商失敗後常藉故毆打阿芳，阿芳於是向法院聲請保護令，卻因阿雄顯有悔意又撤回，但未久阿雄又施暴且變本加厲，致使阿芳終以遭受不堪同居之虐待為由，再次聲請保護令並訴請離婚。試問：本案就保護令部分得否進行調解？又，本案訴請離婚部分，設若法院交由家事調解委員進行調解，阿雄親自出席，阿芳則與法律扶助基金會律師出席，並由家暴防治中心社工人員陪同。經家事調解委員進行調解後，雙方同意離婚，二個未成年子女之權利義務由阿芳行使負擔，阿雄得每月二次與子女會面交往，每月並應給付阿芳新臺幣五千元之子女扶養費用。試問上開調解程序是否合法？