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智腸檢.iMe:運用全長16S rRNA定序技術-建立台灣人腸道菌相資料庫
作者 賴紫綸蘇揚迪許逸堯許秀卿劉元淯戴怡安薛博仁
中文摘要
腸道微生物組對人體健康至關重要,然而目前缺乏針對台灣人群的特定研究。為填補這一空白,本研究開發了名為’’智腸檢.iMe’’的平台,旨在建立台灣本土化的腸道菌相資料庫。該平台採用PacBio HiFi第三代定序技術進行全長16S rRNA基因分析,使用非侵入性方法採集糞便樣本,並通過自動化核酸萃取和生物資訊分析流程進行處理。我們分析了500名健康台灣人和2,493個臨床樣本的腸道菌群,結果顯示智腸檢.iMe在物種水平分類上達到94.52%的準確率,顯著高於傳統V3-V4區域定序的69.18%。研究發現台灣人腸道中比菲德氏菌屬(Bifidobacterium)的分佈與國際文獻報告相似,但在某些菌種豐富度上存在差異。在臨床樣本中,我們檢測到多種腸道病原菌,如艱難梭菌(Clostridioides difficile)的檢出率為2.695%,與國際報告相符。智腸檢.iMe為台灣人群提供了高精度的腸道菌相分析工具,並開始建立本土化的腸道菌相資料庫,為台灣的個人化醫療和精準健康管理奠定了基礎,有望推動本土腸道微生物組研究的發展。
起訖頁 45-49
關鍵詞 腸道菌相全長16S rRNA定序微生物組個人化醫療台灣人群
刊名 台灣醫檢雜誌  
期數 202409 (39:3期)
出版單位 台灣醫事檢驗學會
該期刊-上一篇 復發性乳房膿瘍患者組織檢體分離出歐洲放線菌Actinomyces europaeus之案例報告
 

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