全基因親緣分析於黴菌感染群突發疫情調查之應用

侵襲性黴菌感染好發於免疫低下或接受侵入性醫療的病人。近年來發生數起與醫療照顧相關的黴菌感染群突發事件，另2011年美國龍捲風過境後出現皮膚軟組織毛黴菌症群突發，顯示醫療環境和自然環境中都存在威脅人類健康的伺機性黴菌病原。為了釐清群突發病原的來源及傳播，除了人、時、地三要素關聯性分析外，病原分子分型（genotyping）是疫情調查中不可或缺的第四要素。傳統的黴菌親緣分析方法，如多位點序列分型或變異性重複序列分析等，雖然容易操作，但卻有鑑別度（discriminatory power）不足的缺點。此外，目前也僅部分臨床常見的致病菌種具有已建立的基因分型方法可應用。