第八識的種子說與三世實有問題

成唯識論在第二卷中以「能持有種子」之喻說明第八識的特性（註），在第三卷中再以「瀑流」為喻說明持有種子的第八識的恆常性與變化性（註），這是成唯識論中關於「第八識之種子理論」的重要段落，在這些段落唯識家對「第八識的恆常性與轉變性」，以「種子說」提出精細的說明，其要點俱在「種子六義」（註）中。唯識學從此一「識恆轉」說得出關於一項過去、未來、現在三世因果理論：過去、未來法皆非實有，緣起諸法皆為第八識所變現；這與小乘一切有部主張之「三世實有、法體恆常」相衝突（註），故在成唯識論第三卷中專以論證駁斥（註）。