中央法規標準法第16條：「法規對其他法規所規定之同一事項而為特別之規定者，應優先適用之。其他法規修正後，仍應優先適用。」行政程序法第3條第1項：「行政機關為行政行為時，除法律另有規定外，應依本法規定為之。」行政程序法第34條：「行政程序之開始，由行政機關依職權定之。但依本法或其他法規之規定有開始行政程序之義務，或當事人已依法規之規定提出申請者，不在此限。」及行政程序法第35條前段：「當事人依法向行政機關提出申請者，除法規另有規定外，得以書面或言詞為之。」鑑於上述規定，專利法與行政程序法之關係十分緊密，即發生行政程序法於專利行政程序關係如何適用之問題。