Sub1A基因控制水稻淹水的耐受性

大部分的水稻品種在持續淹水1周後就會死亡，這是造成南亞和東南亞水稻產量減少的主因，估計每年因此而造成的損失超過10億美金。然而，有少數品種如Oryza sativa ssp. indica cultivar FR13A可以在持續淹水2個星期後繼續存活，科學家發現這樣的差異主要是和一群位於第9條染色體著絲點附近的數量遺傳基因座Submergence 1（Sub1）有關。加州大學植物病理所的科學家們發現在Sub1基因座中有3個基因Sub1A、Sub1B和Sub1C（ethylene-response-factor-like gene）。其中Sub1B和Sub1C在水稻2個亞種（japonica和indica type）中都存在，但Sub1A則有品種間的差異，不具有Sub1A基因的水稻品種無法在淹水下存活，而即使具有Sub1A基因也分為Sub1A-1（耐淹水）和Sub1A-2（不耐淹水）2種不同的基因型。